Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIN4Q56A73 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPIN4Q56A73 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms