Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COBLL1Q53SF7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms