Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL12Q53G59 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL12Q53G59 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL12Q53G59 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms