Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PAN2Q504Q3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAN2Q504Q3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PAN2Q504Q3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms