Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CFAP221Q4G0U5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFAP221Q4G0U5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms