Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CERKLQ49MI3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CERKLQ49MI3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CERKLQ49MI3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CERKLQ49MI3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CERKLQ49MI3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms