Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF260Q3ZCT1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF260Q3ZCT1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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