Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCQ8

TIMM50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50Q3ZCQ8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMM50Q3ZCQ8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM50Q3ZCQ8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms