Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT71Q3SY84 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT71Q3SY84 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms