Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC25A52Q3SY17 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC25A52Q3SY17 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms