Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00303Q3SY05 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00303Q3SY05 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00303Q3SY05 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00303Q3SY05 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00303Q3SY05 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00303Q3SY05 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00303Q3SY05 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms