Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM30BQ3MIR4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM30BQ3MIR4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms