Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSM12Q3MHD2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LSM12Q3MHD2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms