Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ANKRD55Q3KP44 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD55Q3KP44 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD55Q3KP44 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms