Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM71Q2Q1W2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM71Q2Q1W2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms