Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TSR1Q2NL82 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSR1Q2NL82 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR1Q2NL82 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms