Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CSPP1Q1MSJ5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSPP1Q1MSJ5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms