Protein–RNA interactions for Protein: Q16877

PFKFB4, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB4Q16877 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PFKFB4Q16877 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PFKFB4Q16877 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms