Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1R3AQ16821 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1R3AQ16821 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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