Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
STX1AQ16623 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STX1AQ16623 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
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