Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NFE2Q16621 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
NFE2Q16621 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NFE2Q16621 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms