Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PKN1Q16512 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKN1Q16512 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
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