Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIK5Q16478 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIK5Q16478 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIK5Q16478 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
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