Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNGA3Q16281 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNGA3Q16281 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNGA3Q16281 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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