Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F4Q16254 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
E2F4Q16254 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F4Q16254 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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