Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC6Q16204 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC6Q16204 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms