Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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VAMP3Q15836 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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VAMP3Q15836 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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VAMP3Q15836 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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VAMP3Q15836 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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VAMP3Q15836 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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VAMP3Q15836 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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VAMP3Q15836 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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VAMP3Q15836 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAMP3Q15836 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAMP3Q15836 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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