Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEC23BQ15437 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SEC23BQ15437 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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SEC23BQ15437 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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SEC23BQ15437 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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SEC23BQ15437 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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SEC23BQ15437 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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SEC23BQ15437 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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SEC23BQ15437 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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SEC23BQ15437 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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SEC23BQ15437 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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SEC23BQ15437 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEC23BQ15437 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEC23BQ15437 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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