Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC23AQ15436 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC23AQ15436 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC23AQ15436 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
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