Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IRF4Q15306 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF4Q15306 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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