Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDGFRLQ15198 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFRLQ15198 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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