Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAM2Q15035 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAM2Q15035 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAM2Q15035 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAM2Q15035 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAM2Q15035 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAM2Q15035 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAM2Q15035 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAM2Q15035 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAM2Q15035 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAM2Q15035 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAM2Q15035 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAM2Q15035 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms