Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAPTM4AQ15012 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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