Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSPNQ14714 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SSPNQ14714 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SSPNQ14714 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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