Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP1BQ14684 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP1BQ14684 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP1BQ14684 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP1BQ14684 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP1BQ14684 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP1BQ14684 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
RRP1BQ14684 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RRP1BQ14684 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP1BQ14684 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
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