Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3AQ14563 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3AQ14563 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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