Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SQLEQ14534 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SQLEQ14534 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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