Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CDK13Q14004 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CDK13Q14004 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CDK13Q14004 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
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