Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPSQ13938 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPSQ13938 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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