Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1DQ13901 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1DQ13901 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1DQ13901 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1DQ13901 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1DQ13901 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
C1DQ13901 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1DQ13901 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1DQ13901 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1DQ13901 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1DQ13901 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1DQ13901 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1DQ13901 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1DQ13901 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1DQ13901 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1DQ13901 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1DQ13901 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1DQ13901 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1DQ13901 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1DQ13901 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1DQ13901 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1DQ13901 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
C1DQ13901 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
C1DQ13901 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1DQ13901 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1DQ13901 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1DQ13901 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1DQ13901 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1DQ13901 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1DQ13901 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
C1DQ13901 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
C1DQ13901 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1DQ13901 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
C1DQ13901 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1DQ13901 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1DQ13901 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1DQ13901 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1DQ13901 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1DQ13901 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1DQ13901 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1DQ13901 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1DQ13901 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1DQ13901 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1DQ13901 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1DQ13901 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1DQ13901 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1DQ13901 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1DQ13901 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1DQ13901 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1DQ13901 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1DQ13901 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1DQ13901 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1DQ13901 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1DQ13901 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1DQ13901 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1DQ13901 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1DQ13901 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1DQ13901 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1DQ13901 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1DQ13901 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1DQ13901 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1DQ13901 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1DQ13901 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1DQ13901 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1DQ13901 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1DQ13901 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1DQ13901 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1DQ13901 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1DQ13901 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1DQ13901 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1DQ13901 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1DQ13901 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1DQ13901 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1DQ13901 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1DQ13901 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1DQ13901 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1DQ13901 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1DQ13901 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C1DQ13901 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1DQ13901 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1DQ13901 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1DQ13901 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1DQ13901 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1DQ13901 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1DQ13901 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1DQ13901 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1DQ13901 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1DQ13901 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1DQ13901 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1DQ13901 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1DQ13901 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1DQ13901 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1DQ13901 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1DQ13901 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1DQ13901 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1DQ13901 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C1DQ13901 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1DQ13901 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1DQ13901 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1DQ13901 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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