Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
EXOSC2Q13868 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EXOSC2Q13868 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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