Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ALCAMQ13740 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALCAMQ13740 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
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