Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CUL4BQ13620 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CUL4BQ13620 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms