Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CUL3Q13618 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL3Q13618 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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