Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MTMR3Q13615 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTMR3Q13615 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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