Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PICALMQ13492 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PICALMQ13492 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PICALMQ13492 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
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