Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKRN4PQ13434 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKRN4PQ13434 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKRN4PQ13434 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
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