Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRSF6Q13247 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SRSF6Q13247 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SRSF6Q13247 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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