Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MRPL28Q13084 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPL28Q13084 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL28Q13084 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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