Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF1Q13077 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF1Q13077 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
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